افتتح برنامج الدراسات العليا خلال فصل الربيع للعام الدراسي 1980/1981إفرنجي، حيث أعدَّ  برنامج ، يهدف إلي توجيه الطلاب الملتحقين به إلى التخصصات الدقيقة.

تُمنح درجة الإجازة العالية (الماجستير) في الفيزياء وفقاً للشروط التي تنص عليها اللائحة الداخلية للدراسات العليا بالكلية ، وبعد إنجاز الطالب (30) وحدة دراسية مقسمة على النحو التالي :

تسع وحدات دراسة إجبارية يدرسها الطالب خلال الفصل الأول  .

سبع وحدات دراسية إجبارية يدرسها الطالب خلال الفصل الثاني .

ثماني وحدات إجبارية يدرسها الطالب خلال الفصل الثالث في أحد التخصصات :

الفيزياء النووية . 

الفيزياء الحالة الصلبة .

الفيزياء النظرية .

الفيزياء الحيوية.

ست وحدات دراسية لمشروع يسجله الطالب في الفصل الرابع ، وفقاً للتخصصات السابقة .